پوهنتون هریوا یک نهاد علمی – تحصیلی خصوصی می باشد که در رأس آن ریاست عمومی پوهنتون و تحت آن هفت بخش کلیدی، معاونیت علمی، معاونیت مالی و اداری، معاونیت امور محصلان، معاونیت تحقیقات علمی ریاست پوهنحی ستوماتولوژی، ریاست پوهنحی کمپیوتر ساینس و ریاست پوهنحی حقوق و علوم سیاسی قرار دارد. هر یک از این بخش ها مسؤل مدیریت، تهیه و ترتیب پلان، اجراأت، نظارت و ارزیابی تمام فعالیت های مربوطه بخش خویش بوده و مستقیماً به ریاست مؤسسه گزارش ده می باشند. هیأت امنأ پوهنتون هریوا مشتمل بر رئیس و سه معاونین پوهنتون می باشد که تصامیم راهبردی و عمده توسط این هیأت گرفته می شود.

یکی از رسالت های مهم و اساسی پوهنتون هریوا فراهم نمودن زمینه آموزش با کیفیت عالی از طریق تدریس معیاری، تربیه کدر های مسلکی، جذب  ظرفیت های علمی جهت تولید دانش از طریق تألیف مقالات علمی و تدویر سمینار های علمی و تلاش در جهت کاربردی ساختن دانش روز از راه  انجام تحقیقات علمی و شناسایی چالش های موجود جامعه و ارائه پیشنهاد ها برای رفع آنها می باشد. بناءً برای رسیدن به این امر مهم پوهنتون هریوا همواره با برگزاری سمینار های علمی، ترتیب و تنظیم پلان های کاری، علمی و تحقیقاتی، انتخاب اساتید مجرب و ورزیده و … تمام سعی و تلاش خویش را مبذول داشته است.

پوهنتون هریوا با داشتن صنوف مجهز، امکانات و محیط مناسب تحصیلی در واقع یکی از پیشروترین پوهنتون در ارایه خدمات به محصلین خویش در حوزه غرب میباشد. در اختیار داشتن مالکیت تعمیر پوهنتون که در یکی از بهترین و مصئون ترین اماکن شهر هرات میباشد باعث اطمینان شهروندان گردیده و همه ساله تعداد کثیری از محصلین را جذب خویش مینماید. علاوتا وجود اساتید مجرب و متعهد در چوکات دیپارتمنت های پوهنتون و برخورداری از کدر اداری متخصص از دیگر عوامل است که محصلین را قادر ساخته تا نهایت استفاده را از زمان صرف شده در طول دوران تحصیلی شان در پوهنتون بنمایند.